Εκατοντάδες επιστήμονες παροτρύνουν ότι τα δεδομένα γονιδιώματος SARS-CoV-2 πρέπει να κοινοποιούνται πιο ανοιχτά για να βοηθήσουν στην ανάλυση του τρόπου με τον οποίο διαδίδονται οι ιογενείς παραλλαγές σε όλο τον κόσμο.
Οι ερευνητές έχουν δημοσιεύσει τεράστιο αριθμό αλληλουχιών γονιδιώματος SARS-CoV-2 στο διαδίκτυο από τον Ιανουάριο του 2020. Η πιο δημοφιλής πλατφόρμα ανταλλαγής δεδομένων, που ονομάζεται GISAID , φιλοξενεί πλέον περισσότερα από 450.000 ιικά γονιδιώματα. Η Soumya Swaminathan, επικεφαλής επιστήμονας της Παγκόσμιας Οργάνωσης Υγείας (ΠΟΥ), το χαρακτήρισε «παιχνίδι αλλαγής» “game changer” στην πανδημία. Αλλά δεν επιτρέπει την κοινή χρήση αλληλουχιών δημοσίως, γεγονός που παρεμποδίζει τις προσπάθειες κατανόησης του κοροναϊού και της ταχείας αύξησης νέων παραλλαγών, υποστηρίζει ο Rolf Apweiler, συν-διευθυντής του Ευρωπαϊκού Ινστιτούτου Βιοπληροφορικής (EBI) κοντά στο Cambridge του Ηνωμένου Βασιλείου, το οποίο φιλοξενεί τη δική του μεγάλη βάση δεδομένων γονιδιώματος που περιλαμβάνει αλληλουχίες SARS-CoV-2.
«Το άνοιγμα των δεδομένων αλληλουχίας SARS-CoV-2 είναι ζωτικής σημασίας για την ταχεία ανταπόκριση ενάντια στη μεγαλύτερη απειλή για την υγεία της ανθρωπότητας σε πολύ, πολύ μεγάλο χρονικό διάστημα», λέει ο Apweiler.
Σε επιστολή που κυκλοφόρησε στις 29 Ιανουαρίου, ο Apweiler και άλλοι ζητούν από τους ερευνητές να δημοσιεύσουν τα δεδομένα γονιδιώματός τους σε μια τριάδα βάσεων δεδομένων που δεν θέτουν περιορισμούς στην αναδιανομή δεδομένων: το US GenBank, το Ευρωπαϊκό Αρχείο Νουκλεοτιδίων του EBI (ENA) και η Τράπεζα Δεδομένων DNA της Ιαπωνίας, η οποία είναι συλλογικά γνωστή ως η Διεθνής Συνεργασία Βάσεων Δεδομένων Νουκλεοτιδίων (INSDC) .
Συνέχεια